توکومی هاناسا کی، دختری در کلاس دوم راهنمایی است که به گل‌ها و گیاهان عشق می‌ورزد. روزی رویایی عجیبی می‌بیند که در آن درختی عظیم شکوفا ظاهر می‌شود و ناگهان همه گل‌هایش از دست می‌رود و دو پری پدیدار می‌شوند. چند روز بعد از انتقال او به آکادمی میودو، پری‌ها از رویا به سوی او می‌آیند و از او درخواست می‌کنند که قهرمان افسانه‌ای Pretty Cure شود تا درخت قلب همکلاسی‌اش، ایرکا کورومی، را بازگرداند. با وجود تردیدها، برای بازگرداندن گل قلب ایرکا، او باید به Pretty Cure تبدیل شود و با دشمنی اسرارآمیز مبارزه کند.