الکل، سیگار کشیدن و استرس—در بدنی که تحت تأثیر این تحریک‌کننده‌ها قرار دارد، سلول‌های مسئول حفظ زندگی به نظر می‌رسد که در جنگی بی‌پایان می‌جنگند. به دلیل کمبود شدید کارگران، سلول قرمز خون AA2153 باید به سرعت یاد بگیرد که اکسیژن را تحویل دهد و دی‌اکسید کربن را جمع‌آوری کند، حتی در شرایط خطرناک. در همین حال، سلول سفید خون U-1196 باید نقش خود را با مقابله با میکروب‌ها و ویروس‌ها در شرایط تهدیدکننده زندگی ایفا کند. در میانه این بحران‌ها، آن‌ها باید با هم کار کنند تا بدن را سالم نگه دارند، با وجود اینکه نمی‌دانند آیا فداکاری‌هایشان ارزشمند خواهد بود یا نه. سلول‌ها در کار! کد سیاه رویکرد متفاوتی را با نشان دادن جنبه‌های سخت‌گیرانه کارهایی که سلول‌های ما انجام می‌دهند، اتخاذ می‌کند.