ژَنراتور گول سری أنی ما بین دهه نود است. داستان در سال 2007 اتفاق می‌افتد، وقتی پروفسور تاکوما نِکاسا کدی ژنتیکی را کشف می‌کند که اسرار بزرگ بدن انسان را فاش می‌کند و بشریت را در معرض تهدیدی بزرگ قرار می‌دهد. نتیجتاً گاول، کوجی و ریوجو—سه دانشمند جوان از دوره‌ای آینده—به زمان عقب سفر می‌کنند تا این اشتباه را برطرف سازند. اما سه‌گانه قصد داشتند یک سال قبل از فاجعه برسند، به جای آن سه ماه قبل به واقعه وارد می‌شوند. در تلا‌شان برای نجات جهان، با ریوکو سائیتو، دانشمند مرموز و حیله‌گر که آینده را به همان گونه که هست ترجیح می‌دهد، مقابله می‌کنند. سائیتو توسط ژنراتورها، قاتلان ماوراءطبیعی که به شکل انسان ظاهر می‌شوند، همراهی می‌شود. در حالی که ریوجو و کوجی می‌کوشند مأموریت‌شان را به پایان برسانند، خود گاول باید «تولید» کند—و به همان قیام دشمنانش، مطابق با آن‌ها بجنگد.